Nakon završetka igračkih dana krenuo je u trenerske vode Slaven Bilić tijekom bogate igračke karijere dijelio je svlačionicu s brojnim vrhunskim nogometašima, ali i vodio teške duele protiv nekih od najboljih napadača svoje generacije.
Slaven Bilić otkrio da mu je Alen Bokšić bio najteži za čuvanje. Složio je "dream team" među suigračima iz "vatrenih" i strancima pun nogometnih legendi U šali često znam reći da mi je najteže bilo s Alenom Bokšićem na treninzima u Hajduku i reprezentaciji.